Détails des 4 offres de thèses :

Sujet de thèse : "Souffrance au travail et consommation de substances psychoactives chez les agents territoriaux de la Communauté de commune des Terres du Val de Loire (TraPsyCOL)"
Encadrant : Raphaël Serreau, équipe Neurobiologie des récepteurs et innovations thérapeutiques
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Sujet de thèse : "Assemblage moléculaire de microARNs synthétiques dans les condensats intracellulaires des cellules de glioblastome humaines"
Encadrants : Patrick Baril et Séverine Morisset-Lopez, équipe Neurobiologie des récepteurs et innovations thérapeutiques
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Sujet de thèse : "Découverte et synthèse chimique totale de D-protéines pour le ciblage moléculaire de glyco-épitopes tumoraux"
Encadrants : Vincent Aucagne et Carlo Pifferi, équipe Protéines de synthèse et chimie bioorthogonale
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Sujet de thèse : "Des nanobodies anti-hOGG1 pour étudier les interactions entre la réparation de l’ADN et la régulation de la transcription et pour moduler l’action de hOGG1 dans des stratégies anti-cancéreuses"
Encadrant : Bertrand Castaing, équipe "Modifications post-traductionnelles des protéines et réparation de l'ADN : structure, fonctions et dynamisme"
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Soutenance de thèse de Christophe DELEHEDDE

Christophe DELEHEDDE, doctorant dans l'équipe "Thérapies innovantes et nanomédecine",  soutiendra sa thèse le lundi 6 novembre 2023 à 14h00 à l'Auditorium Charles Sadron, Campus CNRS d'Orléans.

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Résumé :

Depuis la mise sur le marché des vaccins à ARNm pour le COVID-19, les formulations d'ARNm ont suscité beaucoup d'intérêt. Même si elles ont fait la preuve de leur efficacité vaccinale, d'autres enjeux doivent être relevés, notamment leur sélectivité. Cela concerne le développement de systèmes de délivrance spécifique afin de diriger l'ARNm vers des organes et des cellules d'intérêt. Un h ybride polymère/lipide complexant l'ARNm (LPR, lipopolyplexe) a été décrit par notre équipe comme étant efficace pour la délivrance de l'ARNm. Le premier objectif de ma thèse a été d'étudier l'impact de la charge nette et de la présence d'un ligand trimannosylé d'une formulation de LPR, sur la capture et l'efficacité de transfection des cellules dendritiques. Les résultats montrent que la q uantité de ligand portée par la formulation peut avoir un impact négatif sur l'efficacité de transfection tout en augmentant l’internalisation. Un routage rapide vers les compartiments acides induit une forte activation des senseurs moléculaires PKR et de NF -kB. De manière intéressante, cet effet peut être contrecarré par l'utilisation d'un ARNm portant des nucléosides modifiés et présentant une coiffe de type cap 1 induisant une activation accrue de la protéine mTOR. Aujourd'hui, les thérapies à base d'ARNm ont un potentiel considérable en immunothérapie. Le deuxième objectif de la thèse a été de développer différents types de nanoparticules lipidiques (LNP  et  lipoplexes) pour  délivrer  efficacement l'ARNm dans  des  cellules Natural Killer  (NK)  très  difficiles à  transfecter. Ce s formulations ont permis une transfection élevée (80%) tout en préservant la viabilité cellulaire. Elles ont permis une délivrance efficace d’un ARNm codant pour la protéine interleukine 2 (IL-2) dans des lignées cellulaires humaines NK (NK-92 et Khyg-1) et primaires humaines. Une amélioration de la prolifération des cellules NK in vitro a été mesurée par rapport à l'utilisation de protéine recombinante IL-2. En outre, aucun impact négatif sur les biomarqueurs d’activation et leurs capacités cytotoxiques a été observé. Ces résultats ouvrent la voie à l'utilisation de nanoparticules lipidiques et d'ARNm pour les stratégies thérapeutiques utilisant les cellules NK. De manière intéressante, ces formulations sont également très efficaces pour transfecter différents types de cel lules immunitaires (cellules dendritiques, macrophages, lymphocytes B et T). De plus, elles sont également efficaces chez la souris après avoir été administrées par différentes voies. Pour conclure, les résultats obtenus soulignent l'importance du choix minutieux de tous les composants de la formulation pour obtenir une bonne internalisation et une traduction efficace de l'ARNm, en vue de son utilisation pour différentes thérapies.

Soutenance de thèse de Valentin BEAUVAIS

Valentin BEAUVAIS, doctorant dans l'équipe "DAIV : Dérégulation de l'Autophahie lors de l'inflammation due au VIH",  soutiendra sa thèse le mercredi 5 juillet 2023 à 14h00 à l'Auditorium Charles, Campus CNRS d'Orléans.

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Résumé :

La transcription des ARN messagers (mRNAs) est un processus complexe qui implique une grande diversité d’acteurs à des étapes bien précise. La production d’un mRNA passe également par sa maturation en particule ribonucleoprotéique (mRNP) par l’ajout de protéines qui vont l’empaqueter, le protéger et le rendre compétent à l’export au cytoplasme ou il sera traduit en protéine. Cette étape est surveillée par un système de contrôle qualité qui détecte les rares mRNPs aberrantes et induit leur dégradation par l’une des exonucléases de l’exosome, Rrp6. Le taux d’erreur lors de la maturation des mRNAs est très faible et ne permet pas l’étude du système de QC. L’induction du facteur bactérien Rho provoque la formation des mRNPs aberrantes nécessaire à l’étude tout en évitant de supprimer d’éventuels acteurs de ce système de QC. Cette étude se focalise sur le complexe THO, une pierre angulaire de la maturation des mRNAs car il est recruté pendant la transcription et sert ensuite de plateforme d’interaction pour d’autres protéines d’empaquetage. L’utilisation de méthode d’analyses sur génome entier (ChIP-seq) a révélé l’implication de la protéine Tho2 dans la détection des transcrits aberrants et leur dégradation par Rrp6, indépendamment du complexe THO. De plus, une approche similaire (RNA-seq) sur des levures dépourvues de Rrp6 a mis une fois de plus en évidence l’importance de la dégradation des ncRNAs dans la régulation de l’expression de gènes codants. Pour finir, l’extension de l’utilisation de Rho depuis la levure chez l’humain pourrait révéler à terme l’implication des granules de stress nucléaires (nuclear speckles) dans le contrôle qualité des mRNAs chez l’humain.