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Aspects moléculaires du vivant

Objectifs

L’équipe rassemble des chercheurs de plusieurs disciplines (chimie, biologie, biophysique) partageant un langage moléculaire commun. Les recherches développées ont pour but de comprendre les mécanismes moléculaires fondamentaux qui sous-tendent les processus biologiques et leur régulation. Les avancées en chimie, biochimie, biophysique et biologie moléculaire sont utilisées pour sonder les systèmes vivants aux niveaux moléculaire et structural et pour exploiter les résultats afin de concevoir de nouvelles stratégies en thérapie et de nouveaux outils pour décrypter les phénomènes biologiques.

L’équipe gère également les plateformes de RMN et de Spectrométrie de Masse du CBM.

Groupes thématiques

L’équipe est organisée en cinq groupes thématiques :

• Protéines de Synthèse et Chimie Bioorthogonale (responsable : V. Aucagne)

• Remodelage de l’ARN : Facteurs & Mécanismes (responsable : M. Boudvillain)

• Spectrométrie de Masse Fonctionnelle des Métastases (responsable : M. Cadène)

• Réparation de l’ADN : Structure, Fonction et Dynamique (responsable : B. Castaing)

• RMN des Biomolécules (responsable : C. Landon)

L’équipe comprend également un chercheur (Jean-Marc Bonmatin) qui étudie l’impact des pesticides sur la biodiversité (plus d’infos ici).

Principales techniques

• Biologie moléculaire ; mutagénèse ; expression et purification de protéines ; transcription in vitro ; Purification d’ADN et d’ARN ;
• Biochimie ; sondes chimiques et enzymatiques ; footprinting d’ADN et d’ARN ; EMSA ; cinétique enzymatique (transitoire, état stationnaire)
• Spectrométrie de Masse
• Cristallographie aux rayons X ; DLS ; SAXS
• RMN en phase liquide
• Synthèse peptidique en phase solide ; Chimie organique ; ligation chimique
• Chromatographie en phase liquide (HPLC, FPLC)
• Modélisation moléculaire ; Simulations numériques de dynamique moléculaire

Principaux équipements

• RMN 400, 600 (avec passeur d’échantillons), et 700 (avec cryosonde) MHz
• Spectromètres de masse MALDI-TOF ; ESI-Trap MS couplée à la nano-uHPLC ; UHR-Q-TOF avec module ETD et UHR-Q-TOF avec module CID (50% FR2708)
• Hotte stérile à flux laminaire
• Robot de cristallisation et générateur de rayons X.
• Boite à gants pour cristallogenèse en atmosphère inerte
• Système de pipetage automatisé
• Synthétiseur de peptides
• Imageurs moléculaires (phosphorimaging ; fluorescence)
• Instruments de cinétique rapide (chemical quench flow ; stopped flow)
• Systèmes HPLC et FPLC
• Clusters PC Linux pour la simulation numérique


Membres de l’équipe

Responsables
BOUDVILLAIN Marc Directeur de recherche CNRS, Coordinateur de l’équipe  @
CADENE Martine Directrice de recherche CNRS, Co-coordinatrice de l’équipe  @

Chercheurs et enseignants-chercheurs
AUCAGNE Vincent Chargé de recherche CNRS   @
BEAUFOUR Martine Maître de conférences, IUT d’Orléans   @
BONMATIN Jean-Marc Chargé de recherche CNRS   @
CASTAING Bertrand Directeur de recherche CNRS   @
CULARD Françoise Chargée de recherche CNRS   @
DELMAS Agnès Directrice de recherche CNRS   @
GARNIER Norbert Maître de conférences de l’Université d’Orléans   @
GUERIN Martine Maître de conférences de l’Université d’Orléans  @
JOUVENSAL Laurence Maître de conférences de l’Université d’Orléans  @
KEITA-PAQUET Françoise Chargée de recherche CNRS  @
LANDON Céline Chargée de recherche CNRS   @
LOTH Karine Maître de conférences de l’Université d’Orléans   @
PILLER Véronique Chargée de recherche CNRS   @
PILLER Friedrich Chargé de recherche INSERM   @

Ingénieurs et Techniciens
BERTRAND Marylène Ingénieur de recherche CNRS   @
COLAS Cyril Ingénieur de recherche CNRS (50% FR2708)   @
COSTE Franck Ingénieur de recherche CNRS   @
EVENO Eric Ingénieur de recherche CNRS @
GABANT Guillaume Ingénieur d’études CNRS   @
GOFFINONT Stéphane Ingénieur d’études CNRS   @
LELIEVRE Dominique Ingénieur de recherche CNRS  @
MARCEAU Philippe Ingénieur d’études CNRS @
MEUDAL Hervé Ingénieur d’études CNRS @
NADAN Virginie Technicienne CNRS   @
SCHWARTZ Annie Ingénieur d’études CNRS   @

Doctorants
BRAKA Abdennour   @
CASAS MORA Alba @
MONGIS Aline @
NADIRAS Cédric   @
RIEUX Charlotte   @

Personnels sous contrat
JOUSSET Guillaume CDD Assistant ingénieur @
SOAERES Emilie CDD Assistant ingénieur   @
TERRIER Victor CDD Chercheur @


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