Centre de biophysique moléculaire - UPR 4301

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Accueil du site > Thèmes de recherche > Acides nucléiques et proteines : Structure et intéractions > Interactions ribonucléoprotéiques et applications thérapeutiques

Intéractions ribonucleoprotéiques et applications thérapeutiques

Quels facteurs modulent la synthèse de l’ARN ?

DESCRIPTIF DU TRAVAIL DE RECHERCHE

L’activité de recherche de l’équipe porte sur l’étude des mécanismes moléculaires de la régulation des gènes au niveau de l’élongation du transcrit, sa maturation et son empaquetage en particule ribonucléoprotéique apte à être exportée vers le cytoplasme pour la traduction. Nous nous intéressons tout particulièrement au facteur Rho, une protéine bactérienne de la famille des hélicases hexamériques qui interagit avec des régions nues du transcrit naissant pour induire la terminaison de transcription en des sites situés en aval. Une partie de nos études vise à comprendre au niveau moléculaire la chaine d’événements transitoires conduisant à la dissociation du complexe transcriptionnel par Rho. L’autre partie de nos recherches consiste à utiliser les propriétés de la protéine Rho et de la terminaison de transcription Rho-dépendante dans des cribles génétiques novateurs pour rechercher et étudier des interactions ARN-proteines in vivo. Une première utilisation de cet outil biotechnologique consiste à rechercher dans des extraithèques et des chimiothèques des inhibiteurs compétitifs de complexes ribonucléoprotéiques d’intérêt thérapeutique tel que la télomérase. Une deuxième variante du crible est utilisée pour révéler et caractériser de nouveaux facteurs impliqués dans la biogenèse et l’export des particules ribonucleoprotéiques chez la levure Saccharomyces cerevisiae. Cette approche est basée sur la perturbation des gènes de la levure induite par l’expression hétérologue du facteur de terminaison bactérien Rho qui agit comme compétiteur dans l’interaction entre le transcrit et les protéines servant à sa maturation, empaquetage et export.

Voir la liste des principales publications

Schwartz, A ; Margeat, E ; Rahmouni, AR ; Boudvillain, M Transcription termination factor rho can displace streptavidin from biotinylated RNA J. Biol. Chem. (2007) 282 31469-31476

Toulme, F ; Mosrin-Huaman, C ; Artsimovitch, I ; Rahmouni, AR Transcriptional pausing in vivo : A nascent RNA hairpin restricts lateral movements of RNA polymerase in both forward and reverse directions J. Mol. Biol. (2005) 351 (1) 39-51

Vieu, E ; Rahmouni, AR Dual role of boxB RNA motif in the mechanisms of termination/antitermination at the lambda tR1 terminator revealed in vivo J. Mol. Biol. (2004) 339 (5) 1077-1087

Schwartz, A ; Rahmouni, AR ; Boudvillain, M The functional anatomy of an intrinsic transcription terminator Embo J. (2003) 22 (13) 3385-3394

Toulme, F ; Mosrin-Hauman, C ; Sparkowski, J ; Das, A ; Leng, M ; Rahmouni, AR GreA and GreB proteins revive backtracked RNA polymerase in vivo by promoting transcript trimming Embo J. (2000) 19 (24) 6853-6859

ILLUSTRATION : L’Elongation du transcrit par l’ARN polymErase

Diverses approches expérimentales sont utilisées pour comprendre les mécanismes moléculaires qui régulent la transcription pendant la phase d’élongation.

RAHMOUNI Rachid Directeur de recherche CNRS , Responsable de l’équipe @