La technique MALDI-TOF permet l'analyse de biomolécules pures ou dans des mélanges complexes, avec une bonne tolérance à des éléments du tampon. Les molécules ainsi analysées au CBM sont des protéines entières (membranaires, glycosylées, ...), peptides, glycopeptides, phosphopeptides, oligonucléotides, glycanes, polymères et de petites molécules organiques.
Pour les molécules de masse inférieure à 4000Da, nous pouvons déterminer la masse précise (monoisotopique) correspondant à la masse exacte théorique de la molécule.
Ces analyses peuvent être effectuées dans plusieurs optiques :
- Vérifier la qualité d'un produit issu de synthèse organique, de génie biologique ou d'une purification biochimique
- Identifier des modifications post-traductionnelles ou induites des protéines, les produits d'une réaction chimique
- Analyser des mélanges de peptides issus de la protéolyse d'une protéine isolée (cartographie peptidique)
- Observer des complexes protéine/ligand covalents