Nouvel article de l’équipe “Transfert d’acides nucléiques par des systèmes non viraux “

Dans le cadre du consortium « DNA-nanoparticles for skeletal muscle and airway epithelium in vivo gene therapy » soutenu par l’AFM, une étude comparée des voies d’endocytose de différents vecteurs chimiques a été réalisée dans l’équipe P. Midoux & C. Pichon. Pour cette étude, des outils cellulaires exprimant des compartiments intracellulaires fluorescents ont été préparés et utilisés afin de suivre par microscopie confocale de fluorescence l’entrée et le devenir de l’ADN vectorisé dans les myoblastes. Les résultats publiés dans Biomaterials montrent que l’efficacité de la transfection est plutôt corrélée à la nature de la voie endocytaire qu’à la quantité de matériel endocyté. Elle montre également l’importance de ces outils cellulaires pour suivre le devenir intracellulaire d’une nanoparticule par microscopie fluorescente en temps réel.

Billiet L, Gomez JP, Berchel M, Jaffrès PA, Le Gall T, Montier T, Bertrand E, Cheradame H, Guégan P, Mével M, Pitard B, Benvegnu T, Lehn P, Pichon C and Midoux P

Gene transfer by chemical vectors, and endocytosis routes of polyplexes, lipoplexes and lipopolyplexes in a myoblast cell line.

Biomaterials. 2012 Jan 11.

 

Une molécule clé pour la chimie prébiotique obtenue en laboratoire

De l’hydantoïne a été obtenue en laboratoire dans des conditions similaires à celles existant au sein des glaces interstellaires. C’est le résultat auquel viennent d’arriver des chercheurs de l’Institut d’Astrophysique Spatiale (CNRS, Université Paris-sud), du Centre de Biophysique Moléculaire (CNRS) et de la NASA. Issue de la condensation de l’urée et de l’acide glycolique présentes par ailleurs dans les météorites, l’hydantoïne, peut jouer le rôle de catalyseur pour la formation de chaines peptidiques. Cette formation de proto-protéines peut avoir lieu dans des conditions adéquates, telles celles qui existaient dans les océans de la Terre primitive, étape probablement essentielle à l’apparition de la vie.

Référence de l’article scientifique :

« Prebiotic Significance of Extraterrestrial Ice Photochemistry : Detection of Hydantoin in Organic Residues »
Pierre de Marcellus, Marylène Bertrand, Michel Nuevo, Frances Westall, and Louis Le Sergeant d’Hendecourt. L., Astrobiology, vol. 11, no. 9, p. 847-854, Novembre 2011.

Voir l’article

Un article de l’équipe “Senseurs optiques et sondes oligonucléotidiques pour bioanalyses et imagerie” vient de paraître dans le journal “Journal of the American Chemical Society”

Titre : Optimizing Sensitization Processes in Dinuclear Luminescent Lanthanide Oligomers: Selection of Rigid Aromatic Spacers

Références : J. Am. Chem. Soc., 2011, 133 (40), pp 16219–16234

Auteurs : Jean-François Lemonnier, Laure Guénée, César Beuchat, Tomasz A. Wesolowski, Prasun Mukherjee, David H. Waldeck, Kristy A. Gogick, Stéphane Petoud and Claude Piguet

DOI: 10.1021/ja206806t

Accès pour abonnés portail BiblioVie

Résumé :

This work illustrates a simple approach for optimizing the lanthanide luminescence in molecular dinuclear lanthanide complexes and identifies a particular multidentate europium complex as the best candidate for further incorporation into polymeric materials. The central phenyl ring in the bis-tridentate model ligands L3–L5, which are substituted with neutral (X = H, L3), electron-withdrawing (X = F, L4), or electron-donating (X = OCH3, L5) groups, separates the 2,6-bis(benzimidazol-2-yl)pyridine binding units of linear oligomeric multi-tridentate ligand strands that are designed for the complexation of luminescent trivalent lanthanides, Ln(III). Reactions of L3–L5 with [Ln(hfac)3(diglyme)] (hfac– is the hexafluoroacetylacetonate anion) produce saturated single-stranded dumbbell-shaped complexes [Ln2(Lk)(hfac)6] (k = 3–5), in which the lanthanide ions of the two nine-coordinate neutral [N3Ln(hfac)3] units are separated by 12–14 Å. The thermodynamic affinities of [Ln(hfac)3] for the tridentate binding sites in L3–L5 are average (6.6 ≤ log(β2,1Y,Lk) ≤ 8.4) but still result in 15–30% dissociation at millimolar concentrations in acetonitrile. In addition to the empirical solubility trend found in organic solvents (L4 > L3 L5), which suggests that the 1,4-difluorophenyl spacer in L4 is preferable, we have developed a novel tool for deciphering the photophysical sensitization processes operating in [Eu2(Lk)(hfac)6]. A simple interpretation of the complete set of rate constants characterizing the energy migration mechanisms provides straightforward objective criteria for the selection of [Eu2(L4)(hfac)6] as the most promising building block.

Un article de l’équipe “Simulation numérique, modélisation et dynamique moléculaires” vient de paraître dans le journal “FEBS Letters” .

Il a également été choisi comme couverture de cette édition.

Samia Aci-Sèche, Monique Genest, Norbert Garnier
Ligand entry pathways in the ligand binding domain of PPARγ receptor
FEBS Letters – 585 (16) 2599-2603
– doi : 10.1016/j.febslet.2011.07.014

 

Résumé :
To address the question of ligand entry process, we report targeted molecular dynamics simulations of the entry of the flexible ionic ligand GW0072 in the ligand binding domain of the nuclear receptor PPARγ. Starting with the ligand outside the receptor the simulations led to a ligand docked inside the binding pocket resulting in a structure very close to the holo-form of the complex. The results showed that entry process is guided by hydrophobic interactions and that entry pathways are very similar to exit pathways. We suggest that TMD method may help in discriminating between ligands generated by in silico docking.

Accès au texte intégral par BiblioVie