Acquisition des spectres RMN
Traitement et analyse de données RMN
- NMRPipe/Draw Transformation des spectres RMN (1D à 4D) et analyses automatisées des cartes RMN.
- NMRView , CCPN et Sparky Attribution et analyse des spectres RMN.
- CSI Prédiction de la structure secondaire des protéines à partir des déplacements chimiques (HA, CA, CB).
- TALOS Prédiction des angles de torsions Φ et Ψ du squelette des protéines à partir des déplacements chimiques (HA, CA, CB, CO, N).
- DANGLE (Dihedral ANgles from Global Likelihood Estimates) Prédiction des angles φ et ψ et des structures secondaires
Modélisation moléculaire à partir de données RMN Utilisation des contraintes de distances, d’angles de torsions, d’orientation des liaisons mesurées par RMN pour construire et affiner les structures 3D des biomolécules.
Dynamique Interne
- Modelfree Détermination des paramètres “modelfree” de Lipari-Szabo à partir de données de relaxation hétéronucléaire.
Docking
- HADDOCK Détermination de structures de complexes protéine-protéine, protéine-ADN et protéine-ligand à partir de données expérimentales.
Modélisation par Homologie
Visualisation des structures 3D