Présentation des sujets de thèses des doctorants de 1ère année

Le mardi 4 mars 2025, les 8 doctorants de 1ère année du CBM – CNRS UPR4301 ont présenté leurs sujets de thèses à l’ensemble du personnel du laboratoire. Ce moment convivial a été l’occasion d’échanges enrichissants.
Les sujets présentés sont très variés : ils vont de l’étude des effets du plasma froid sur la cicatrisation en condition d’apesanteur, la vectorisation, les D-protéines au traitement des problèmes osseux de patients atteints de maladies rénales, en passant par la recherche de nouvelles voies de traitement du glioblastome.

👏 Bravo à ces nouveaux doctorants pour leurs recherches innovantes qui augurent des résultats prometteurs.

Sur la photo, de bas en haut et de gauche à droite :
Nada Ibrahim, Dounia Hezili, Victor Lapointe, Walaa Khazaal, Elizaveta Gaiamova, Grégoire Negroni, Septuce Zin.
N’est pas sur la photo : Ana Gil Quevedo.

Détails des 4 offres de thèses :

Sujet de thèse : "Souffrance au travail et consommation de substances psychoactives chez les agents territoriaux de la Communauté de commune des Terres du Val de Loire (TraPsyCOL)"
Encadrant : Raphaël Serreau, équipe Neurobiologie des récepteurs et innovations thérapeutiques
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Sujet de thèse : "Assemblage moléculaire de microARNs synthétiques dans les condensats intracellulaires des cellules de glioblastome humaines"
Encadrants : Patrick Baril et Séverine Morisset-Lopez, équipe Neurobiologie des récepteurs et innovations thérapeutiques
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Sujet de thèse : "Découverte et synthèse chimique totale de D-protéines pour le ciblage moléculaire de glyco-épitopes tumoraux"
Encadrants : Vincent Aucagne et Carlo Pifferi, équipe Protéines de synthèse et chimie bioorthogonale
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Sujet de thèse : "Des nanobodies anti-hOGG1 pour étudier les interactions entre la réparation de l’ADN et la régulation de la transcription et pour moduler l’action de hOGG1 dans des stratégies anti-cancéreuses"
Encadrant : Bertrand Castaing, équipe "Modifications post-traductionnelles des protéines et réparation de l'ADN : structure, fonctions et dynamisme"
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Marie Curie Postdoctoral Fellowships

Rafael Aroso, originaire de l’Université de Coimbra, Portugal, rejoindra l’équipe « Complexes métalliques et IRM ». Son projet « PorphIRON » vise à développer des complexes paramagnétiques basés sur les métaux de transition, comme le fer, pour des applications en IRM. Ce travail s’inscrit dans les efforts de l’équipe à remplacer le gadolinium, actuellement utilisé en IRM, par des métaux plus biocompatibles et écologiquement plus soutenables.

Ross Ballantine, venu de la Queen’s University Belfast en Irlande du Nord, rejoindra l’équipe « Protéines de Synthèse et Chimie Bioorthogonale » pour travailler sur le projet « ThioSHowcase ». Ce projet vise à explorer des acides aminés thiophénoliques pour la fonctionnalisation chimiosélective de peptides et protéines, en particulier pour des applications au marquage de protéines et à la réticulation de peptides.

Félicitations à Lylia Azoug pour son prix poster !

Lylia Azoug, doctorante de l'équipe "Protéines de synthèse et chimie bioorthogonale" a reçu le prix poster lors de la conférence "Chemical Biology Symposium 2024" organisée par la Société Chimique de France .

Résumé du poster  :

Generation of specific antibodies against peptides requires their covalent conjugation to large protein carriers, such as keyhole limpet hemocyanin (KLH), to override their inherently weak immunogenicity. For this, most approaches exploit the highly-efficient thiol-maleimide ligation, which enables for the attachment of multiple copies of peptides displaying a single cysteine thiol group, onto a variety of commercial maleimide-functionalized carriers. Concerning disulfide-containing peptides and proteins, introduction of a spare thiol moiety permits a follow-up thiol-maleimide reaction; nevertheless, disulfide bonds are highly susceptible to undergo intramolecular thiophilic attack by the thiolate required for the reaction, with consequent impairing of their native bridging framework. This “disulfide scrambling” would alter the peptide 3D structure, impairing specificity of elicited antibodies for the native target. In recent reports, thiol-functionalized spacers were introduced on disulfide-containing peptides to generate protein conjugates for immunization purposes, 1,2 nevertheless the occurrence of disulfide scrambling was not examined, therefore we sought to systematically evaluate the influence of different thiol-functionalized spacers. Using the N-terminal domain of the Lingo1 protein as a model peptide (20 amino acids, 2 disulfide bridges), we probed a small battery of thiol-containing spacers with variable length and rigidity. Interestingly, while flexible linkers, comparable with previously described ones,1,2 showed considerable disulfide scrambling upon 2 h under thiol-maleimide reaction conditions (pH 6.6), a short and rigid oligoproline-based linker3 abolished the disruption of the disulfide framework. The reported strategy provides a valuable resource for the bioconjugation of disulfide-containing peptides via standard thiol-maleimide chemistry while maintaining the structural integrity of the disulfide framework, thereby providing homogeneous tools for research and biomedical applications.

  1. Katayama, H.; Mita, M. A sulfanyl-PEG derivative of relaxin-like peptide utilizable for the conjugation with KLH and the antibody production. Bioorganic & ; Med. Chem. 2016, 24 (16), 3596–3602. DOI : 10.1016/j.bmc.2016.05.068
  2. Katayama, H.; Mizuno, R.; Mita, M. A novel approach for preparing disulfide-rich peptide-KLH conjugate applicable to the antibody production. Biosci. Biotechnol. Biochem2019, 83 (10), 1791–1799. DOI : 10.1080/09168451.2019.1618696
  3. Wilhelm, P.; Lewandowski, B.; Trapp, N.; Wennemers, H. A Crystal Structure of an Oligoproline PPII-Helix, at Last.J. Am. Chem. Soc2014, 136 (45), 15829–15832. DOI : 10.1021/ja507405j

Présentations des doctorants de 1ère année

Les 9 doctorants de première année du CBM ont présenté leurs sujets de thèses à leurs collègues lors d'une session posters qui s'est déroulée le 7 mars 2023.

Les nouveaux doctorants sont :

  • Lylia Azzoug, dans l'équipe "Protéines de synthèse et chimie bioorthogonale"
  • Sara Ben Jemaa et Adrien Uguen, dans l'équipe "Complexes métalliques et IRM"
  • Ivan Ciganek, dans l'équipe " Thérapies innovantes et nanomédecine"
  • Thuy-Duong Do, dans l'équipe "Remodelage de l'ADN : structures et mécanismes"
  • Sebastian Gfellner et Pamela Guerillot, dans l'équipe "Exobiologie"
  • Lucija Mance, dans l'équipe "Modifications post-traductionnelles des protéines et réparation de l'ADN"
De bas en haut et de gauche à droite : Sebastian GFELLNER, Sara BEN JEMAA, Giuliano MIGLIORINI, Lylia AZZOUG, Pamela GUERILLOT, Ivan CIGANEK, Adrien UGUEN, Lucija MANCE, Thuy-Duong DO