Catégorie d'actualités : Publications marquantes

[Relaxometry Studies of a Highly Stable Nanoscale Metal−Organic Framework Made of Cu(II), Gd(III), and the Macrocyclic DOTP
Carné-Sánchez A., Bonnet C.S., Imaz I., Lorenzo J., Tóth E. and Maspoch D.
J. Am. Chem. Soc., 2013, 135 (47) 17711–17714 – doi: 10.1021/ja4094378->http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja4094378]

Résumé :
L’imagerie par Résonance Magnétique Nucléaire (IRM) est une technique de diagnostic médical très puissante du fait de son caractère non invasif et de sa très grande résolution spatiale. L’injection d’agents de contraste est souvent nécessaire pour augmenter le contraste intrinsèque des images IRM. La plupart des agents de contraste utilisés actuellement sont des complexes stables de Gd(III), un cation lanthanide fortement paramagnétique. Cependant certaines limitations persistent avec les agents actuels en particulier du fait de leur faible sensibilité, de leur manque de sélectivité, et de leur faible temps de rétention in vivo. Cela en fait des agents efficaces uniquement dans les zones de forte accumulation. Les nanoMOFS (nanoscale metal-organic frameworks) qui ont un temps de circulation in vivo augmenté par rapport aux petits complexes, et qui présentent l’avantage de pouvoir transporter de grandes quantités de Gd(III) par unité cristalline commencent à être étudiés comme alternative aux autres agents de contraste. Pour la première fois, les propriétés relaxométriques de ces nano-objets complexes ont été étudiées en détails afin d’avoir une meilleure compréhension de ces systèmes. Nous décrivons ici un MOF hétérométallique dans lequel le ligand macrocyclique DOTP est utilisé pour complexer des cations Cu(II) et Gd(III). Ce MOF a été miniaturisé à l’échelle nanométrique, et il est stable en milieu physiologique, en milieu de culture cellulaire, et il n’est pas cytotoxique. Sa relaxivité passe par un maximum à 40 MHz, et reste importante à haut champ (500 MHz). Ces valeurs de relaxivité sont constantes sur une large gamme de pH et augmentent avec la température.

 

[Stuparevic, I., Mosrin-Huaman, C., Hervouet-Coste, N., Remenaric, M. and Rahmouni, A. R.
Co-transcriptional recruitment of the RNA exosome cofactors Rrp47p, Mpp6p and two distinct TRAMP complexes assists the exonuclease Rrp6p in the targeting and degradation of an aberrant mRNP in yeast
Journal of Biological Chemistry 288 (44) 31816-31829 – doi : 10.1074/jbc.M113.491290->http://www.jbc.org/content/early/2013/09/18/jbc.M113.491290]

Résumé :

Destinés à être traduits en protéines dans le cytoplasme, les ARNm eucaryotes vont subir depuis leur synthèse dans le noyau jusqu’à leur transport vers le cytoplasme un nombre important de modifications qui incluent des modifications chimiques et des assemblages complexes avec des protéines afin de former des particules ribonucléoprotéiques (mRNP). La fidélité de ces processus conditionne l’export des mRNP vers le cytoplasme. Toutes les cellules eucaryotes ont donc développé des mécanismes de surveillance qui contrôlent la qualité des mRNP et éliminent les particules défectueuses. En stimulant, in vivo, la production des transcrits aberrants, nous avons observé une augmentation du recrutement co-transcriptionnel de l’exonucléase Rrp6p faisant de ce cofacteur de l’exosome l’acteur principal de la machinerie de dégradation nucléaire. Les protéines Rrp47p et Mpp6p, cofacteurs de l’exosome, se sont révélées être des facteurs importants pour la stimulation de l’activité de Rrp6p, importance renforcée par la mise en évidence d’une stabilisation interdépendante entre Rrp47p et Rrp6p. De la même façon, la participation significative des composants du complexe TRAMP (Trf4p, Trf5p, Air2p) au processus d’élimination des transcrits aberrants a été démontrée alors que l’exosome contribue modestement voire pas du tout à ce mécanisme. Ainsi, en disséquant un à un les composants impliqués dans la surveillance d’un transcrit modèle, nous avons frayé la voie à une analyse globale des transcrits aberrants produits dans des conditions physiologiques, étude indispensable à la compréhension de la dynamique de la transcription par les ARN polymérases II.

L’imagerie de fluorescence permet d’observer le vivant en mouvement. Seulement, dans ce domaine, les marqueurs entrent très souvent en compétition avec la fluorescence naturelle du milieu biologique. Les premiers marqueurs stables, non toxiques et suffisamment performants sous lumière proche infrarouge pour une exploitation en imagerie de fluorescence, viennent d’être mis au point par l’équipe “Senseurs optiques et sondes oligonucléotidiques pour bioanalyses et imagerie” dirigée par le Docteur Stéphane Petoud, en collaboration avec l’Université de Pittsburgh (USA).

Cette recherche a fait l’objet d’un communiqué de presse du CNRS.

[Alexandra Foucault-Collet, A., Gogick, K.A., White, K.A., Villette, S., Pallier, A., Collet, G., Kieda, C., Li, T., Geib, S.J., Rosi, N.L. and Petoud, S.
“Lanthanide near infrared imaging in living cells with Yb3+ nano Metal Organic Frameworks”
PNAS – Mis en ligne le 8 octobre 2013.->http://www.pnas.org/content/early/2013/10/08/1305910110]

Cela aboutit à la présence fréquente de néonicotinoïdes dans les ruches. Aux doses réellement présentent dans les cultures, les néonicotinoïdes provoquent une vaste gamme d’effets sublétaux chez les abeilles et les colonies de bourdons. Ils affectent la performance de la colonie en diminuant la fécondité, la ponte et le développement larvaire, la mémoire et l’apprentissage, le fonctionnement du système nerveux central, la résistance aux maladies, l’hygiène de la ruche etc. La toxicité des néonicotinoïdes peut être amplifiée par la présence d’autres pesticides. Les nicotinoïdes agissent en synergie avec des agents infectieux, tel que Nosema ceranae, l’ensemble pouvant anéantir les colonies. D’autres données disponibles suggèrent qu’ils peuvent également présenter une toxicité similaire pour pratiquement tous les autres insectes pollinisateurs sauvages. La production mondiale de néonicotinoïdes est en constante augmentation. En conséquence, une transition des néonicotinoïdes vers des alternatives favorables aux pollinisateurs est urgente pour la durabilité des écosystèmes.

 

[van der Sluijs, J. P., Simon-Delso, N., Goulson, D., Maxim, L., Bonmatin, J.-M. and Belzunces, L.P.
Neonicotinoids, bee disorders and the sustainability of pollinator services
Current Opinion in Environmental Sustainability. 5 (3–4) 293–305->http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877343513000493]

 

Transcription termination controls prophage maintenance in Escherichia coli genomesarticle

Proceedings of the National Academy of Sciences 110 (35) 14414-14419

Résumé :
Les prophages sont les formes non-pathologiques (non-lytiques) de virus de bactéries appelés phages. Ce sont des éléments génétiques très répandus qui, intégrés aux génomes bactériens, peuvent conférer un avantage compétitif ou évolutif aux bactéries hôtes. Ces dernières ont donc souvent tout intérêt à ne pas les perdre et mobilisent des mécanismes spécifiques à cet effet. En association avec une équipe marseillaise spécialiste des phages, l’équipe « Helicases & ARN » du CBM vient de révéler un nouveau mécanisme contribuant au maintien de prophages au sein de génomes bactériens. Ce mécanisme implique Rho, une ARN hélicase abondamment étudiée au CBM. Les travaux démontrent que Rho provoque la terminaison de la transcription à un site spécifique au sein du prophage, empêchant ainsi l’expression d’un gène clé pour l’excision de ce dernier (gène rdf pour: recombination directionality factor). Ce nouveau mécanisme complète le (déjà) large répertoire de fonctions du facteur Rho et, parce que les prophages sont souvent des acteurs de virulence bactérienne, confirme l’intérêt qu’il pourrait y avoir à cibler Rho à des fins thérapeutiques.